《恶魔的谜语》故事舞台设定在一个名为“10年黑组”的全住宿制女子高中的班级，这个要知道，现在还是狂风，一旦暴雨倾盆而下，如果再加上电闪雷鸣，那就会很危险，运气不好的，可能被天上劈下来的闪电打成焦炭，运气好一点、的，也可能会被大雨打得睁不开眼，稀里糊涂地进了某个怪兽待的房子就悲剧了。班级里的12名学生都是由暗杀者构成的，她们全都瞄准了她们的同学——一之濑晴的姓命。即使她的姓命被众多人觊觎，一之濑晴依然发誓一定要活着毕业。另一方面，同样也是准备夺取一之濑晴姓命的暗杀者——转校生东兔角却在一次次接近对方时，渐渐地被晴所吸引。在同学们对晴展开攻击之时，兔角则以保护者的姿态与她们开始了战斗。
